2019年12月底新型冠状病毒（简称新冠病毒）肺炎疫情暴发，中国科学院北京基因组研究所（国家生物信息中心）率先响应，成立抗疫攻关团队，开展新冠病毒基因组信息整合与变异鉴定注释等分析工作，于2020年1月22日发布新冠病毒信息库2019nCoVR（https://bigd.big.ac.cn/ncov/），为新冠病毒相关的科学研究、疫情防控等提供服务与支撑。这一工作被写入国务院新闻办公室发布的《抗击新冠肺炎疫情的中国行动》白皮书。

第一版数据库发布之后（相关文章于2020年2月12日在《遗传》杂志中文版发表），抗疫攻关团队不断优化改进变异监测与演化分析方法，丰富完善数据库功能。2020年12月28日，国际学术期刊Genomics, Proteomics & Bioinformatics在线发表题为“The Global Landscape of SARS-CoV-2 Genomes, Variants, and Haplotypes in 2019nCoVR”的2019nCoVR升级版文章，系统介绍该数据库自第一版发布以来的更新情况，包括基因组信息统计、基因组变异全景、基因组变异时空动态、单倍型网络演化四个主要方面。

2019nCoVR收集整合国内外多个数据库公开的新冠病毒基因组数据，提供实时、全面的新冠病毒基因组元信息、数据质量评估、全球分布与统计等，通过人工审编和自动化质量评估，补充增值注释信息。在此基础上，2019nCoVR分析高质量的全长人源病毒基因组数据，注释新冠病毒基因组变异，获得全球范围内新冠病毒基因组变异图谱，基于采样时间和国家进行变异动态展示并构建单倍型网络，监测新冠病毒的时空传播。截至2021年1月4日，2019nCoVR数据库已为全球175个国家／地区的近20万用户提供数据服务，访问量超50万次，累计数据下载超过2.2亿条，有效支撑了北京新发地疫情分子溯源、巴基斯坦国内新冠病毒传播演化分析等工作，在全球抗疫过程中发挥了重要作用。

中国科学院北京基因组研究所（国家生物信息中心）副研究员宋述慧、马利娜（两人均为青年创新促会会员）等为该文共同第一作者，鲍一明研究员、薛勇彪研究员、赵文明正高级工程师、章张研究员为该文共同通讯作者。宋述慧副研究员长期从事基因组序列变异分析及遗传变异与表型关联知识的挖掘应用等研究，在该工作中主要负责新冠病毒基因组序列变异鉴定与注释、时空动态监测、序列单体型演化等分析与研究。马利娜副研究员致力于生物大数据整合与分析挖掘等研究，在该项目中负责全球新冠病毒基因组信息整合、标准化质控审编、结构化入库、基因组注释等工作。本研究得到了中科院青年创新促进会、战略先导专项、信息化专项，以及国家科技部重点研发计划等项目支持。

2019年12月底新型冠状病毒（简称新冠病毒）肺炎疫情暴发，中国科学院北京基因组研究所（国家生物信息中心）率先响应，成立抗疫攻关团队，开展新冠病毒基因组信息整合与变异鉴定注释等分析工作，于2020年1月22日发布新冠病毒信息库2019nCoVR（https://bigd.big.ac.cn/ncov/），为新冠病毒相关的科学研究、疫情防控等提供服务与支撑。这一工作被写入国务院新闻办公室发布的《抗击新冠肺炎疫情的中国行动》白皮书。

第一版数据库发布之后（相关文章于2020年2月12日在《遗传》杂志中文版发表），抗疫攻关团队不断优化改进变异监测与演化分析方法，丰富完善数据库功能。2020年12月28日，国际学术期刊Genomics, Proteomics & Bioinformatics在线发表题为“The Global Landscape of SARS-CoV-2 Genomes, Variants, and Haplotypes in 2019nCoVR”的2019nCoVR升级版文章，系统介绍该数据库自第一版发布以来的更新情况，包括基因组信息统计、基因组变异全景、基因组变异时空动态、单倍型网络演化四个主要方面。

2019nCoVR收集整合国内外多个数据库公开的新冠病毒基因组数据，提供实时、全面的新冠病毒基因组元信息、数据质量评估、全球分布与统计等，通过人工审编和自动化质量评估，补充增值注释信息。在此基础上，2019nCoVR分析高质量的全长人源病毒基因组数据，注释新冠病毒基因组变异，获得全球范围内新冠病毒基因组变异图谱，基于采样时间和国家进行变异动态展示并构建单倍型网络，监测新冠病毒的时空传播。截至2021年1月4日，2019nCoVR数据库已为全球175个国家／地区的近20万用户提供数据服务，访问量超50万次，累计数据下载超过2.2亿条，有效支撑了北京新发地疫情分子溯源、巴基斯坦国内新冠病毒传播演化分析等工作，在全球抗疫过程中发挥了重要作用。

中国科学院北京基因组研究所（国家生物信息中心）副研究员宋述慧、马利娜（两人均为青年创新促会会员）等为该文共同第一作者，鲍一明研究员、薛勇彪研究员、赵文明正高级工程师、章张研究员为该文共同通讯作者。宋述慧副研究员长期从事基因组序列变异分析及遗传变异与表型关联知识的挖掘应用等研究，在该工作中主要负责新冠病毒基因组序列变异鉴定与注释、时空动态监测、序列单体型演化等分析与研究。马利娜副研究员致力于生物大数据整合与分析挖掘等研究，在该项目中负责全球新冠病毒基因组信息整合、标准化质控审编、结构化入库、基因组注释等工作。本研究得到了中科院青年创新促进会、战略先导专项、信息化专项，以及国家科技部重点研发计划等项目支持。

2019年12月底新型冠状病毒（简称新冠病毒）肺炎疫情暴发，中国科学院北京基因组研究所（国家生物信息中心）率先响应，成立抗疫攻关团队，开展新冠病毒基因组信息整合与变异鉴定注释等分析工作，于2020年1月22日发布新冠病毒信息库2019nCoVR（https://bigd.big.ac.cn/ncov/），为新冠病毒相关的科学研究、疫情防控等提供服务与支撑。这一工作被写入国务院新闻办公室发布的《抗击新冠肺炎疫情的中国行动》白皮书。

第一版数据库发布之后（相关文章于2020年2月12日在《遗传》杂志中文版发表），抗疫攻关团队不断优化改进变异监测与演化分析方法，丰富完善数据库功能。2020年12月28日，国际学术期刊Genomics, Proteomics & Bioinformatics在线发表题为“The Global Landscape of SARS-CoV-2 Genomes, Variants, and Haplotypes in 2019nCoVR”的2019nCoVR升级版文章，系统介绍该数据库自第一版发布以来的更新情况，包括基因组信息统计、基因组变异全景、基因组变异时空动态、单倍型网络演化四个主要方面。

2019nCoVR收集整合国内外多个数据库公开的新冠病毒基因组数据，提供实时、全面的新冠病毒基因组元信息、数据质量评估、全球分布与统计等，通过人工审编和自动化质量评估，补充增值注释信息。在此基础上，2019nCoVR分析高质量的全长人源病毒基因组数据，注释新冠病毒基因组变异，获得全球范围内新冠病毒基因组变异图谱，基于采样时间和国家进行变异动态展示并构建单倍型网络，监测新冠病毒的时空传播。截至2021年1月4日，2019nCoVR数据库已为全球175个国家／地区的近20万用户提供数据服务，访问量超50万次，累计数据下载超过2.2亿条，有效支撑了北京新发地疫情分子溯源、巴基斯坦国内新冠病毒传播演化分析等工作，在全球抗疫过程中发挥了重要作用。

中国科学院北京基因组研究所（国家生物信息中心）副研究员宋述慧、马利娜（两人均为青年创新促会会员）等为该文共同第一作者，鲍一明研究员、薛勇彪研究员、赵文明正高级工程师、章张研究员为该文共同通讯作者。宋述慧副研究员长期从事基因组序列变异分析及遗传变异与表型关联知识的挖掘应用等研究，在该工作中主要负责新冠病毒基因组序列变异鉴定与注释、时空动态监测、序列单体型演化等分析与研究。马利娜副研究员致力于生物大数据整合与分析挖掘等研究，在该项目中负责全球新冠病毒基因组信息整合、标准化质控审编、结构化入库、基因组注释等工作。本研究得到了中科院青年创新促进会、战略先导专项、信息化专项，以及国家科技部重点研发计划等项目支持。

2019年12月底新型冠状病毒（简称新冠病毒）肺炎疫情暴发，中国科学院北京基因组研究所（国家生物信息中心）率先响应，成立抗疫攻关团队，开展新冠病毒基因组信息整合与变异鉴定注释等分析工作，于2020年1月22日发布新冠病毒信息库2019nCoVR（https://bigd.big.ac.cn/ncov/），为新冠病毒相关的科学研究、疫情防控等提供服务与支撑。这一工作被写入国务院新闻办公室发布的《抗击新冠肺炎疫情的中国行动》白皮书。

第一版数据库发布之后（相关文章于2020年2月12日在《遗传》杂志中文版发表），抗疫攻关团队不断优化改进变异监测与演化分析方法，丰富完善数据库功能。2020年12月28日，国际学术期刊Genomics, Proteomics & Bioinformatics在线发表题为“The Global Landscape of SARS-CoV-2 Genomes, Variants, and Haplotypes in 2019nCoVR”的2019nCoVR升级版文章，系统介绍该数据库自第一版发布以来的更新情况，包括基因组信息统计、基因组变异全景、基因组变异时空动态、单倍型网络演化四个主要方面。

2019nCoVR收集整合国内外多个数据库公开的新冠病毒基因组数据，提供实时、全面的新冠病毒基因组元信息、数据质量评估、全球分布与统计等，通过人工审编和自动化质量评估，补充增值注释信息。在此基础上，2019nCoVR分析高质量的全长人源病毒基因组数据，注释新冠病毒基因组变异，获得全球范围内新冠病毒基因组变异图谱，基于采样时间和国家进行变异动态展示并构建单倍型网络，监测新冠病毒的时空传播。截至2021年1月4日，2019nCoVR数据库已为全球175个国家／地区的近20万用户提供数据服务，访问量超50万次，累计数据下载超过2.2亿条，有效支撑了北京新发地疫情分子溯源、巴基斯坦国内新冠病毒传播演化分析等工作，在全球抗疫过程中发挥了重要作用。

中国科学院北京基因组研究所（国家生物信息中心）副研究员宋述慧、马利娜（两人均为青年创新促会会员）等为该文共同第一作者，鲍一明研究员、薛勇彪研究员、赵文明正高级工程师、章张研究员为该文共同通讯作者。宋述慧副研究员长期从事基因组序列变异分析及遗传变异与表型关联知识的挖掘应用等研究，在该工作中主要负责新冠病毒基因组序列变异鉴定与注释、时空动态监测、序列单体型演化等分析与研究。马利娜副研究员致力于生物大数据整合与分析挖掘等研究，在该项目中负责全球新冠病毒基因组信息整合、标准化质控审编、结构化入库、基因组注释等工作。本研究得到了中科院青年创新促进会、战略先导专项、信息化专项，以及国家科技部重点研发计划等项目支持。